<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><rss version="2.0" xmlns:content="http://purl.org/rss/1.0/modules/content/">
  <channel>
    <title>phind &amp;mdash; Johan&#39;s blog</title>
    <link>https://rant.li/johan/tag:phind</link>
    <description>Random firing of the neurons</description>
    <pubDate>Mon, 13 Jul 2026 11:18:07 +0000</pubDate>
    <item>
      <title>Ретротранспозоны</title>
      <link>https://rant.li/johan/retrotranspozony</link>
      <description>&lt;![CDATA[Ретротранспозоны — это мобильные генетические элементы, которые используют метод &#34;копировать и вставить&#34; для распространения в геноме животных и растений. Они составляют значительную часть генома, например, по крайней мере 45% генома человека и до 20% генома млекопитающих. Процесс передвижения ретротранспозонов включает промежуточную стадию молекулы РНК, которая считывается с участка ретротранспозона и затем используется как матрица для обратной транскрипции в последовательность ДНК. Новосинтезированный ретротранспозон встраивается в другой участок генома.&#xA;!--more--&#xA;Активные ретротранспозоны млекопитающих делятся на три основные семьи: Alu-повторы, ДДП-1, SVA. ДДП-1-ретротранспозоны — длинные диспергированные повторы — тип ретротранспозонов, который широко распространён у млекопитающих и составляет до 20% генома. Процесс передвижения начинается со считывания молекулы РНК с элемента ДДП-1, которая транспортируется в цитоплазму, где от неё транслируются белки, формирующие рибонуклеопротеин, который затем импортируется в ядро для обратной транскрипции ретротранспозона.&#xA;&#xA;ДКП (длинные концевые повторы) — ретротранспозоны, имеющие конечные повторяющиеся последовательности, играют важную роль в транскрипции и обратной транскрипции РНК транспозона. КДП (короткие диспергированные повторы) являются неавтономными ретротранспозонами, требующими активности ДДП-1-элементов для передвижения.&#xA;&#xA;Ретротранспозоны широко распространены у растений, где они часто являются важным компонентом ядерной ДНК. У кукурузы 49-78% генома состоит из ретротранспозонов, а у пшеницы около 90% генома представлены повторяющими последовательностями, из которых 68% — перемещающиеся элементами 2[4].&#xA;&#xA;Citations: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10&#xA;br /&#xA;Ретротранспозоны оказывают значительное влияние на геном человека и млекопитающих, влияя на эволюцию генома, изменение экспрессии генов и генетическую инновацию. Они представляют собой мобильные генетические элементы, которые могут вставляться в новые места в геноме, что может привести к изменениям в структуре и функции генома.&#xA;&#xA;Влияние на геномику: Ретротранспозоны, включая LINE-1 (L1), Alu и SVA элементы, составляют около трети генома человека и активно влияют на его эволюцию. Они могут вызывать мутации, генетическую нестабильность и изменения в экспрессии генов, а также способствовать генетической инновации [2].&#xA;&#xA;Генетическая нестабильность: Ретротранспозоны могут вставляться в генные или регуляторные области, что приводит к мутациям и генетической нестабильности. Это может вызвать различные наследственные заболевания, такие как гемофилия, синдром Кэстера, неврофиброз, дюшеннская мускулярная дистрофия и рак груди и кишечника [2].&#xA;&#xA;Изменения в экспрессии генов: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через альтернативную сплайсинг и эпигенетическую регуляцию. Это может привести к изменениям в функции генов и, следовательно, в фенотипе организма [2].&#xA;&#xA;Генетическая инновация: Ретротранспозоны могут способствовать генетической инновации, например, через формирование новых генов и экзонизацию. Это может привести к появлению новых функций и адаптаций в геноме [2].&#xA;&#xA;Эволюционная динамика: Ретротранспозоны, особенно не-LTR ретротранспозоны, обладают высокой копией и продолжают активность на протяжении десятков миллионов лет, что делает их ключевыми элементами в эволюции генома млекопитающих. Их высокая активность и продолжительное наличие в геноме способствовали их эволюционному успеху [2].&#xA;&#xA;Локальная геномная нестабильность: Ретротранспозоны могут вызывать локальную геномную нестабильность, связанную с вставками и продуктами их протеинов, а также последствиями, влияющими на последовательности ретротранспозонов на более глубоком временном уровне [2].&#xA;&#xA;В целом, ретротранспозоны играют ключевую роль в эволюции генома человека и млекопитающих, влияя на структуру и функцию генома, генетическую нестабильность, экспрессию генов и генетическую инновацию.&#xA;&#xA;Citations: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15&#xA;br /&#xA;Ретротранспозоны влияют на экспрессию генов и фенотип организма различными способами, включая мутагенез, генетическую нестабильность, альтернативный сплайсинг и эпигенетическую регуляцию.&#xA;&#xA;Мутагенез: Ретротранспозоны могут вставляться в генные или регуляторные области, что приводит к мутациям и генетической нестабильности. Это может вызвать различные наследственные заболевания, такие как гемофилия, синдром Кэстера, неврофиброз, дюшеннская мускулярная дистрофия и рак груди и кишечника [2].&#xA;&#xA;Альтернативный сплайсинг: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через альтернативный сплайсинг, что может привести к изменениям в функции генов и, следовательно, в фенотипе организма [2].&#xA;&#xA;Эпигенетическая регуляция: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через эпигенетические механизмы, такие как метилирование ДНК, что также может привести к изменениям в фенотипе организма [2].&#xA;&#xA;Генетическая нестабильность: Ретротранспозоны могут вызывать генетическую нестабильность, что приводит к изменениям в структуре и функции генома, что в свою очередь может влиять на фенотип организма [2].&#xA;&#xA;Генетическая инновация: Ретротранспозоны могут способствовать генетической инновации, например, через формирование новых генов и экзонизацию. Это может привести к появлению новых функций и адаптаций в геноме, что также влияет на фенотип организма [2].&#xA;&#xA;Регуляция активности ретротранспозонов: Хотя ретротранспозоны могут вызывать мутации и генетическую нестабильность, организмы эволюционировали множество защитных систем, включая репрессивные эпигенетические механизмы, для регуляции этих элементов. Это помогает поддерживать стабильность генома и предотвращает нежелательные последствия их активности [3].&#xA;&#xA;В целом, ретротранспозоны играют ключевую роль в экспрессии генов и фенотипе организма, влияя на структуру и функцию генома, генетическую нестабильность, экспрессию генов и генетическую инновацию.&#xA;&#xA;Citations: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10&#xA;&#xA;#generated by #phind]]&gt;</description>
      <content:encoded><![CDATA[<p>Ретротранспозоны — это мобильные генетические элементы, которые используют метод “копировать и вставить” для распространения в геноме животных и растений. Они составляют значительную часть генома, например, по крайней мере 45% генома человека и до 20% генома млекопитающих. Процесс передвижения ретротранспозонов включает промежуточную стадию молекулы РНК, которая считывается с участка ретротранспозона и затем используется как матрица для обратной транскрипции в последовательность ДНК. Новосинтезированный ретротранспозон встраивается в другой участок генома.

Активные ретротранспозоны млекопитающих делятся на три основные семьи: Alu-повторы, ДДП-1, SVA. ДДП-1-ретротранспозоны — длинные диспергированные повторы — тип ретротранспозонов, который широко распространён у млекопитающих и составляет до 20% генома. Процесс передвижения начинается со считывания молекулы РНК с элемента ДДП-1, которая транспортируется в цитоплазму, где от неё транслируются белки, формирующие рибонуклеопротеин, который затем импортируется в ядро для обратной транскрипции ретротранспозона.</p>

<p>ДКП (длинные концевые повторы) — ретротранспозоны, имеющие конечные повторяющиеся последовательности, играют важную роль в транскрипции и обратной транскрипции РНК транспозона. КДП (короткие диспергированные повторы) являются неавтономными ретротранспозонами, требующими активности ДДП-1-элементов для передвижения.</p>

<p>Ретротранспозоны широко распространены у растений, где они часто являются важным компонентом ядерной ДНК. У кукурузы 49-78% генома состоит из ретротранспозонов, а у пшеницы около 90% генома представлены повторяющими последовательностями, из которых 68% — перемещающиеся элементами [2][3][4].</p>

<p>Citations: <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/D0%A0%D0%B5%D1%82%D1%80%D0%BE%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%BE%D0%BD%D1%8B" rel="nofollow">1</a> <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A2%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%BE%D0%BD%D1%8B" rel="nofollow">2</a> <a href="https://dic.academic.ru/dic.nsf/ruwiki/1121040" rel="nofollow">3</a> <a href="https://dic.academic.ru/dic.nsf/ruwiki/677016" rel="nofollow">4</a> <a href="https://www.jove.com/science-education/11573/long-terminal-repeats-ltr-retrotransposons?language=Russian" rel="nofollow">5</a> <a href="https://indicator.ru/label/transpozony" rel="nofollow">6</a> <a href="https://nplus1.ru/news/2019/10/14/mge-developmental-disorders" rel="nofollow">7</a> <a href="https://ru.wiktionary.org/wiki/%D1%80%D0%B5%D1%82%D1%80%D0%BE%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%BE%D0%BD" rel="nofollow">8</a> <a href="https://www.jove.com/science-education/11572/retroviruses-and-retrotransposons?language=Russian" rel="nofollow">9</a> <a href="https://humbio.ru/humbio/epihumblu/001dd5ee.htm" rel="nofollow">10</a>
<br/>
Ретротранспозоны оказывают значительное влияние на геном человека и млекопитающих, влияя на эволюцию генома, изменение экспрессии генов и генетическую инновацию. Они представляют собой мобильные генетические элементы, которые могут вставляться в новые места в геноме, что может привести к изменениям в структуре и функции генома.</p>
<ul><li><p><strong>Влияние на геномику</strong>: Ретротранспозоны, включая LINE-1 (L1), Alu и SVA элементы, составляют около трети генома человека и активно влияют на его эволюцию. Они могут вызывать мутации, генетическую нестабильность и изменения в экспрессии генов, а также способствовать генетической инновации [2].</p></li>

<li><p><strong>Генетическая нестабильность</strong>: Ретротранспозоны могут вставляться в генные или регуляторные области, что приводит к мутациям и генетической нестабильности. Это может вызвать различные наследственные заболевания, такие как гемофилия, синдром Кэстера, неврофиброз, дюшеннская мускулярная дистрофия и рак груди и кишечника [2].</p></li>

<li><p><strong>Изменения в экспрессии генов</strong>: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через альтернативную сплайсинг и эпигенетическую регуляцию. Это может привести к изменениям в функции генов и, следовательно, в фенотипе организма [2].</p></li>

<li><p><strong>Генетическая инновация</strong>: Ретротранспозоны могут способствовать генетической инновации, например, через формирование новых генов и экзонизацию. Это может привести к появлению новых функций и адаптаций в геноме [2].</p></li>

<li><p><strong>Эволюционная динамика</strong>: Ретротранспозоны, особенно не-LTR ретротранспозоны, обладают высокой копией и продолжают активность на протяжении десятков миллионов лет, что делает их ключевыми элементами в эволюции генома млекопитающих. Их высокая активность и продолжительное наличие в геноме способствовали их эволюционному успеху [2].</p></li>

<li><p><strong>Локальная геномная нестабильность</strong>: Ретротранспозоны могут вызывать локальную геномную нестабильность, связанную с вставками и продуктами их протеинов, а также последствиями, влияющими на последовательности ретротранспозонов на более глубоком временном уровне [2].</p></li></ul>

<p>В целом, ретротранспозоны играют ключевую роль в эволюции генома человека и млекопитающих, влияя на структуру и функцию генома, генетическую нестабильность, экспрессию генов и генетическую инновацию.</p>

<p>Citations: <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5631067/" rel="nofollow">1</a> <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2884099/" rel="nofollow">2</a> <a href="https://www.nature.com/articles/s41576-021-00385-1" rel="nofollow">3</a> <a href="https://www.nature.com/articles/s41576-022-00485-6" rel="nofollow">4</a> <a href="https://www.nature.com/articles/s41556-022-00970-4" rel="nofollow">5</a> <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8143547/" rel="nofollow">6</a> <a href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19763152/" rel="nofollow">7</a> <a href="https://www.science.org/doi/10.1126/science.aac7247" rel="nofollow">8</a> <a href="https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s00018-021-03851-5.pdf" rel="nofollow">9</a> <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8257530/" rel="nofollow">10</a> <a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s13258-014-0250-5" rel="nofollow">11</a> <a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-021-03851-5" rel="nofollow">12</a> <a href="https://www.tandfonline.com/doi/full/10.2147/AGG.S57145" rel="nofollow">13</a> <a href="https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27503295/" rel="nofollow">14</a> <a href="https://www.nature.com/articles/nrg2640" rel="nofollow">15</a>
<br/>
Ретротранспозоны влияют на экспрессию генов и фенотип организма различными способами, включая мутагенез, генетическую нестабильность, альтернативный сплайсинг и эпигенетическую регуляцию.</p>
<ul><li><p><strong>Мутагенез</strong>: Ретротранспозоны могут вставляться в генные или регуляторные области, что приводит к мутациям и генетической нестабильности. Это может вызвать различные наследственные заболевания, такие как гемофилия, синдром Кэстера, неврофиброз, дюшеннская мускулярная дистрофия и рак груди и кишечника [2].</p></li>

<li><p><strong>Альтернативный сплайсинг</strong>: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через альтернативный сплайсинг, что может привести к изменениям в функции генов и, следовательно, в фенотипе организма [2].</p></li>

<li><p><strong>Эпигенетическая регуляция</strong>: Ретротранспозоны могут влиять на экспрессию генов через эпигенетические механизмы, такие как метилирование ДНК, что также может привести к изменениям в фенотипе организма [2].</p></li>

<li><p><strong>Генетическая нестабильность</strong>: Ретротранспозоны могут вызывать генетическую нестабильность, что приводит к изменениям в структуре и функции генома, что в свою очередь может влиять на фенотип организма [2].</p></li>

<li><p><strong>Генетическая инновация</strong>: Ретротранспозоны могут способствовать генетической инновации, например, через формирование новых генов и экзонизацию. Это может привести к появлению новых функций и адаптаций в геноме, что также влияет на фенотип организма [2].</p></li>

<li><p><strong>Регуляция активности ретротранспозонов</strong>: Хотя ретротранспозоны могут вызывать мутации и генетическую нестабильность, организмы эволюционировали множество защитных систем, включая репрессивные эпигенетические механизмы, для регуляции этих элементов. Это помогает поддерживать стабильность генома и предотвращает нежелательные последствия их активности [3].</p></li></ul>

<p>В целом, ретротранспозоны играют ключевую роль в экспрессии генов и фенотипе организма, влияя на структуру и функцию генома, генетическую нестабильность, экспрессию генов и генетическую инновацию.</p>

<p>Citations: <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10671454/#:~:text=Retrotransposons%20are%20invasive%20genetic%20elements,mold%20higher%2Dorder%20chromatin%20structures." rel="nofollow">1</a> <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2884099/" rel="nofollow">2</a> <a href="https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/gm311" rel="nofollow">3</a> <a href="http://www.nature.com/scitable/topicpage/transposons-the-jumping-genes-518" rel="nofollow">4</a> <a href="https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2017.01418/full" rel="nofollow">5</a> <a href="https://elifesciences.org/articles/86324" rel="nofollow">6</a> <a href="https://link.springer.com/article/10.1007/s00018-021-03851-5" rel="nofollow">7</a> <a href="https://mobilednajournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13100-019-0161-8" rel="nofollow">8</a> <a href="https://elifesciences.org/reviewed-preprints/86324v2" rel="nofollow">9</a> <a href="https://www.qmul.ac.uk/blizard/study/postgraduate-research/phd-projects/evaluating-the-impact-of-line-1-retrotransposons-on-cancer-gene-expression/" rel="nofollow">10</a></p>

<p><a href="/johan/tag:generated" class="hashtag" rel="nofollow"><span>#</span><span class="p-category">generated</span></a> by <a href="/johan/tag:phind" class="hashtag" rel="nofollow"><span>#</span><span class="p-category">phind</span></a></p>
]]></content:encoded>
      <guid>https://rant.li/johan/retrotranspozony</guid>
      <pubDate>Wed, 03 Apr 2024 16:24:53 +0000</pubDate>
    </item>
  </channel>
</rss>